應用數學與交叉科學研究中心于2025年4月30日進行大組會，全體成員和各位導師共同參加。在這次組會上，由兩名研一學生和兩名研二學生分别彙報自己的研究進展，然後老師與同學們對彙報内容進行學術探讨，并對存在的問題給出相應的指導和建議。

吳浩然：本次彙報了一篇文獻。複雜的染色體組織目前可以通過實驗技術來測量，但染色質的時空動力學仍然難以捉摸。DNA通常被分子集合覆蓋，形成染色質，染色質有自己的内在結構，由稱為核小體的圓柱形蛋白質複合物施加。與物理領域研究的聚合物一樣，由核小體組成的染色質（本文稱為染色質聚合物）也有其自身的内在結構，這種結構肯定參與了不同空間尺度間長時間相關性的産生。該文獻的目标是使用一個簡化的（即，在某些假設下）染色質聚合物模型，通過推導表征染色質空間運動的統計量的分析結果來揭示染色質動力學的主要特征。該模型實際上是經典Rouse聚合物模型的擴展，因為它額外考慮了E-P相互作用，說明了增強子與其同源啟動子之間的通信。

韋情晴：‍本次彙報了一篇文獻。本研究提出了一種用于CBCT-to-CT圖像合成的能量引導擴散模型（EGDiff），旨在提升CBCT圖像的質量和臨床應用價值。該方法基于DDPM擴散模型，引入了領域适應潛力函數與領域差異潛力函數，分别保留CBCT的解剖結構特征并引導合成圖像接近真實CT的風格。通過将能量函數嵌入反擴散過程，模型在無監督設置下實現了高質量的sCT生成。實驗在胸部腫瘤數據集上進行，與多種主流GAN及擴散模型對比，EGDiff在SSIM、MAE、PSNR和NCC等指标上均取得最優表現，展示出其在自适應放療中的廣泛應用潛力。

楊虎：‍本次彙報了一篇文獻。RNA是一類具有重要生物學功能的分子，在細胞生命活動中發揮關鍵作用。研究RNA的結構和功能，不僅揭示其在遺傳信息傳遞、基因調控和催化反應中的多樣化角色，也為理解生命起源和分子機制提供了重要線索。結構研究：RNA由腺嘌呤（A）、胞嘧啶（C）、鳥嘌呤（G）和尿嘧啶（U）構成，通過特定的堿基配對（A-U、G-C和G-U）形成二級結構，如發夾和莖環。這些二級結構是其功能的結構基礎，并進一步折疊形成更複雜的三級結構。RNA分子中的多分支環結構是連接不同螺旋區域的關鍵部位，多分支環中分支之間的角度分布反映了局部結構的空間構象特征；準确預測這些角度的相對大小關系對于理解RNA的折疊機制具有重要意義。

張春煥：‍本次彙報了一篇文獻。阿片類藥物成瘾是一個全球性的公共衛生危機，尤其是在美國，阿片類藥物過量導緻死亡的人數居高不下，但接受藥物輔助治療的隻有少數。由于阿片類藥物成瘾涉及遺傳和環境因素的影響，因此，深入理解其神經生物學機制對于開發新的治療靶點至關重要。 近年來，多項全基因組關聯研究(GWAS)識别了一些與阿片類藥物成瘾相關的基因變異和表達失調。然而，這些基因并非獨立作用，而是通過複雜的網絡相互影響。因此，本研究采用系統生物學方法，整合了GWAS數據以及來自阿片類藥物過量死亡個體的背外側前額葉皮質(allPFC)的轉錄組學、蛋白質組學和表觀遺傳學數據。通過網絡分析，識别高度互聯的基因網絡，揭示潛在的生物學通路，并尋找新的藥物靶點。研究結果表明，通過整合多組學數據，可以發現與阿片類藥物成瘾相關的基因網絡，并識别出可能對藥物再利用和未來藥物發現有貢獻的關鍵基因。這一多組學整合方法不僅揭示了阿片類藥物成瘾的潛在生物學機制，還為開發新的治療策略提供了科學依據。